两者区别主要体现在：

1、学生的管理机构不同，自考是各级自考办公室，专升本是院校。

2、证书的颁发机构不同，自考是高等教育自学考试委员会，专升本是院校。

3、学制不同，专升本有学制，自考没有学制。

4、学习方式不同，专升本是在校全日制学习，自考是考生自己安排时间(也可参加自考助学班学习)。

5、入学方式不同，专升本有专升本考试，自考没有入学考试。

6、毕业方式不同，专升本通过入学考试后，一般毕业都没有问题，自考则是必须一门一门考，所有科目合格才可以毕业。